Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh1P09803 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh1P09803 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh1P09803 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh1P09803 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh1P09803 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdh1P09803 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh1P09803 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh1P09803 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh1P09803 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh1P09803 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh1P09803 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh1P09803 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh1P09803 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms