Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gnpda1O88958 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gnpda1O88958 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gnpda1O88958 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gnpda1O88958 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gnpda1O88958 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gnpda1O88958 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms