Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx3O70492 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx3O70492 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx3O70492 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx3O70492 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx3O70492 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx3O70492 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx3O70492 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx3O70492 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx3O70492 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx3O70492 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx3O70492 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx3O70492 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms