Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Limk2O54785 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Limk2O54785 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk2O54785 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk2O54785 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Limk2O54785 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limk2O54785 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Limk2O54785 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Limk2O54785 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limk2O54785 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limk2O54785 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk2O54785 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limk2O54785 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limk2O54785 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Limk2O54785 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Limk2O54785 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Limk2O54785 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limk2O54785 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limk2O54785 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limk2O54785 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limk2O54785 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms