Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC28A2O43868 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC28A2O43868 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC28A2O43868 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC28A2O43868 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC28A2O43868 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms