Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn6O35646 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn6O35646 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn6O35646 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn6O35646 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn6O35646 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn6O35646 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn6O35646 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn6O35646 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn6O35646 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Capn6O35646 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn6O35646 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn6O35646 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn6O35646 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn6O35646 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn6O35646 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn6O35646 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn6O35646 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn6O35646 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn6O35646 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn6O35646 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn6O35646 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn6O35646 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn6O35646 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn6O35646 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn6O35646 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn6O35646 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn6O35646 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn6O35646 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn6O35646 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn6O35646 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn6O35646 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms