Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pnldc1B2RXZ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pnldc1B2RXZ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pnldc1B2RXZ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pnldc1B2RXZ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pnldc1B2RXZ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pnldc1B2RXZ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pnldc1B2RXZ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnldc1B2RXZ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pnldc1B2RXZ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pnldc1B2RXZ1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pnldc1B2RXZ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms