Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC017007.1-201ENST00000511960 415 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ADAM20P1-202ENST00000556964 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMO3Q8TAP4 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms