Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PDE4DIP-208ENST00000464103 1055 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 AC116631.1-202ENST00000640984 683 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
USP18Q9UMW8 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms