Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL390882.1-201ENST00000618821 594 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL450313.1-201ENST00000366376 452 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AQP4-203ENST00000440832 1169 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC078955.1-201ENST00000547123 882 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SGCZQ96LD1 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms