Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SNX29P2-204ENST00000603801 875 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 KRT23-202ENST00000436344 1485 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CCR8-202ENST00000414803 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXD12P35452 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXD12P35452 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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HOXD12P35452 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ZNF24-204ENST00000589881 7419 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD12P35452 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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