Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZIM3-201ENST00000269834 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL137220.1-201ENST00000431369 661 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC100854.1-201ENST00000520351 341 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 BX664727.3-202ENST00000421686 1761 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 CLEC1B-202ENST00000348658 869 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
E2F1Q01094 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms