Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPL5P9-201ENST00000448118 886 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC067817.2-201ENST00000459965 387 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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