Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC012513.1-201ENST00000417481 784 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
VPS8Q8N3P4 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
VPS8Q8N3P4 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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