Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L1-201ENST00000614055 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IGLV6-57-201ENST00000390285 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC034228.1-201ENST00000424244 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 KDM4A-AS1-203ENST00000434346 833 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP002383.1-201ENST00000439405 720 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 OR2M3-201ENST00000456743 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL856P-201ENST00000461754 298 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC074051.1-201ENST00000470389 781 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL659P-201ENST00000483093 299 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL434P-201ENST00000495872 271 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MED30-204ENST00000522839 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FRG2JP-201ENST00000568299 832 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL246P-201ENST00000584467 296 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IPP-202ENST00000396478 3113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC009044.1-201ENST00000624577 1798 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 TTC33-205ENST00000636106 2252 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 PIGA-201ENST00000333590 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 C1S-205ENST00000406697 3076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB20-AS1-203ENST00000475939 1687 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RAB3IP-215ENST00000551641 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 SUGT1P3-201ENST00000304932 1051 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 TMEM244-201ENST00000368143 545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC073621.2-201ENST00000381380 1024 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 FCAR-206ENST00000391724 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RMDN2-AS1-201ENST00000414365 859 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC015468.1-201ENST00000523852 874 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms