Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC087499.3-202ENST00000441215 1173 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TIMD4-203ENST00000407087 1145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PSMA6P2-201ENST00000457574 686 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms