Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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HOXD12P35452 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXD12P35452 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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