Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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HOXD10P28358 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
HOXD10P28358 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
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