Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC098487.1-204ENST00000506972 610 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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USP18Q9UMW8 AC083843.1-201ENST00000521444 849 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC022182.1-202ENST00000529234 580 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
USP18Q9UMW8 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
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USP18Q9UMW8 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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