Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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CNPPD1Q9BV87 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CNPPD1Q9BV87 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 SAP18-207ENST00000607003 2234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CNPPD1Q9BV87 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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CNPPD1Q9BV87 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AL109924.2-201ENST00000419800 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 RPL24P8-201ENST00000446071 474 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CNPPD1Q9BV87 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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