Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AKR1C4-201ENST00000263126 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AL596325.2-201ENST00000609669 505 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LMO3Q8TAP4 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 ZNF569-205ENST00000589833 762 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
LMO3Q8TAP4 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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