Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL021707.2-202ENST00000422408 1080 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC126615.1-201ENST00000470084 630 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC005837.2-201ENST00000587459 479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL139317.4-201ENST00000605879 760 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
AP3M2P53677 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms