Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC02470-201ENST00000412084 979 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RPL5P3-201ENST00000493817 889 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC117473.1-201ENST00000508616 392 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC010333.1-201ENST00000563116 563 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC091178.1-204ENST00000577328 366 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC00632-203ENST00000602535 723 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RPL10P16-201ENST00000325000 645 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 Z99943.2-201ENST00000507585 266 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC092336.1-201ENST00000510562 415 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AP006437.1-202ENST00000530327 933 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms