Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TXNRD1-204ENST00000429002 3855 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC004941.1-201ENST00000417506 3120 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MTRNR2L1-201ENST00000540040 1553 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NELL2-202ENST00000395487 3203 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZCCHC6-205ENST00000375960 4939 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HCG18-242ENST00000602319 3342 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 YY1AP1-203ENST00000347088 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CTAGE6-201ENST00000470691 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SYT6-202ENST00000607941 4352 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BBS10-201ENST00000393262 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NRXN3-202ENST00000335750 2764 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC090983.1-201ENST00000623426 3897 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PPP2R1B-201ENST00000311129 2082 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HCAR2-201ENST00000328880 2051 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PDPN-201ENST00000294489 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GRHL2-202ENST00000395927 2140 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 FCRLA-210ENST00000367959 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 NLRP12-204ENST00000391773 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 PDE8A-208ENST00000557957 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL135924.2-201ENST00000427901 361 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02020-204ENST00000435548 604 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.6 ms