Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IGLV1-51-201ENST00000390290 389 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TRBV7-5-201ENST00000390382 345 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IL5RA-206ENST00000430514 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL590094.1-203ENST00000435649 828 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC243962.1-201ENST00000441512 579 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL391825.1-202ENST00000458136 741 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL621P-201ENST00000472565 299 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL448P-201ENST00000475566 295 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL130P-201ENST00000489463 305 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 UGT2B28-202ENST00000511240 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC00499-204ENST00000515282 579 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC018448.2-201ENST00000548295 305 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RAB5B-210ENST00000553116 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC013452.1-201ENST00000560630 598 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC024559.2-202ENST00000615240 529 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ALG13-226ENST00000622986 582 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC005841.2-201ENST00000637658 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 snoMe28S-Am2634.2-201ENST00000637869 80 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PABPC5-201ENST00000312600 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC004862.1-209ENST00000437763 1678 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PACRG-201ENST00000337019 1619 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LARGE-AS1-203ENST00000438159 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PRYP4-201ENST00000306589 444 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MAGOH-201ENST00000371466 500 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FCRL6-204ENST00000392235 947 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MAGEC3-202ENST00000409007 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC009319.1-201ENST00000411493 754 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A1-AS1-203ENST00000418854 545 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL445430.2-201ENST00000423149 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RPL6P2-201ENST00000425480 783 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC006450.2-201ENST00000429482 581 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01647-201ENST00000453135 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PHBP9-201ENST00000453578 825 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SCG5-206ENST00000494364 1148 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms