Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 UAP1-203ENST00000367925 2069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 U3.48-201ENST00000363172 216 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 PRELID1P3-201ENST00000450055 643 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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RTL8BQ17RB0 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 AC130456.1-201ENST00000565085 1363 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RTL8BQ17RB0 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RTL8BQ17RB0 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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