Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC103760.1-201ENST00000521326 1486 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CENPK-208ENST00000508421 1586 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SNORA7B-201ENST00000384360 139 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC006013.1-201ENST00000424888 758 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC007879.1-201ENST00000435643 554 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC016734.1-201ENST00000436998 654 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RN7SL272P-201ENST00000487762 289 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC098583.2-201ENST00000504151 372 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 DNM1P47-201ENST00000560757 334 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TMX3-204ENST00000562706 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 MIR4682-201ENST00000580643 80 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC008392.1-201ENST00000600941 437 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PDCD1Q15116 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC104078.1-201ENST00000499292 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PDCD1Q15116 PSG9-203ENST00000291752 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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