Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 KRT23-202ENST00000436344 1485 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
E2F1Q01094 DNAAF4-203ENST00000448430 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CASK-204ENST00000378166 3123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 WDR45BP1-201ENST00000583470 1029 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
E2F1Q01094 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms