Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 CADPS-220ENST00000613879 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC244021.2-201ENST00000445260 529 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 EFCAB2-207ENST00000447569 527 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RN7SL587P-201ENST00000459853 281 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RPL23AP82-208ENST00000496652 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC114786.3-201ENST00000509304 705 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 LINC02200-203ENST00000513687 541 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 DCSTAMP-203ENST00000517991 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 CCDC58P5-201ENST00000536923 432 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AP000619.1-201ENST00000540293 1000 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ETFRF1-210ENST00000556927 833 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 LINC02296-201ENST00000557070 544 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AL109918.2-201ENST00000605188 279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 MFSD8-234ENST00000641503 1082 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 G6PC2-204ENST00000429379 645 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HLA-DQB1P01920 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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