Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINGO1-AS1-202ENST00000558887 1124 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP003071.2-201ENST00000562772 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC215522.1-201ENST00000615488 446 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 GZMB-209ENST00000616551 559 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.176-201ENST00000619772 282 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL121785.1-201ENST00000624745 708 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 BTK-201ENST00000308731 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PACRG-AS2-201ENST00000418665 1300 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PIGN-231ENST00000639174 4095 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FADS2P1-201ENST00000611807 1446 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 C1GALT1C1-202ENST00000371313 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 GLYATL2-202ENST00000532258 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PRSS51-203ENST00000636217 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL135818.1-202ENST00000554096 1740 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SIRPD-202ENST00000381623 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02111-201ENST00000505158 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1AP3-201ENST00000423650 319 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 FTH1P20-201ENST00000434913 548 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PRSS37-203ENST00000438520 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC023137.1-201ENST00000448241 308 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL365436.1-201ENST00000452587 495 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL355312.3-201ENST00000472053 312 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC010307.4-202ENST00000507403 389 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 JRKL-AS1-201ENST00000511243 426 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC087639.1-201ENST00000560974 920 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 WASF4P-201ENST00000444248 1494 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC020895.2-201ENST00000624996 1839 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 MYOCD-203ENST00000425538 8466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP42P5-201ENST00000548856 2936 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN5B-201ENST00000358992 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms