Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079238.1-201ENST00000509840 1009 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1I3-233ENST00000515452 1093 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162171.2-201ENST00000555444 905 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRAIC-204ENST00000558781 1222 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00469-203ENST00000579749 583 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO4P1-201ENST00000592909 177 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353649.1-201ENST00000625060 619 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00595-211ENST00000634735 535 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00604-202ENST00000637924 684 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR9K2-204ENST00000641374 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016722.2-201ENST00000429761 1835 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A1P4-201ENST00000359165 1405 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF343-202ENST00000358413 771 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390786.1-201ENST00000432108 309 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00307-201ENST00000451410 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450023.2-201ENST00000453276 545 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNP3-201ENST00000454560 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNAB1-AS1-201ENST00000467794 456 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6M3P-201ENST00000531567 700 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTAN1P3-201ENST00000535885 715 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MESTP2-201ENST00000559787 889 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7L1P5-201ENST00000590816 738 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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