Protein–RNA interactions for Protein: S4R3F8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3F8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
S4R3F8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
S4R3F8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
S4R3F8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms