Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PHLDA3Q9Y5J5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHLDA3Q9Y5J5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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