Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SH3BP1Q9Y3L3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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SH3BP1Q9Y3L3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SH3BP1Q9Y3L3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SH3BP1Q9Y3L3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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