Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP3Q9Y3E7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP3Q9Y3E7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms