Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO2Q9Y3B8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms