Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM2AQ9Y2K7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM2AQ9Y2K7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms