Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms