Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAF8Q9UPN6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms