Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
L1RE1Q9UN81 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
L1RE1Q9UN81 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms