Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHA12Q9UN75 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms