Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNPO2Q9UMS6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms