Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND2AQ9ULE3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND2AQ9ULE3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms