Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRNDQ9UKY0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms