Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PACSIN3Q9UKS6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms