Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TSPAN16Q9UKR8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms