Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GTF3C4Q9UKN8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF3C4Q9UKN8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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