Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSKSQ9UJT2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSKSQ9UJT2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms