Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCF2Q9UG63 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCF2Q9UG63 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms