Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUX4Q9UBX2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms